兽用B超系统采取两级存储结构：一级结构是以30天为时间限制的短期存储结构，采用的介质是属于磁介质的硬盘，现在市面上普通的硬盘存储容量已达到80GB，这完全能够符合很多兽医的短期兽用B超图像存储要求；
二级结构是大容量长期备份，采用的介质是属于光学介质的CD-ROM和磁带，由于刻录光驱的普及，使得其成本比可重写的磁光盘要低，一张光盘的容量通常为650MB，一般来讲，一幅几百K的兽用B超超声图像就可满足诊断的需要，因此，一张光盘可以容纳数百例诊断结果；使用磁带作为查询定位的时间相对长得多，故一般用来作为紧急状态下的数据恢复，如主要的存储介质遭到破坏时。

兽用B超图像测量之前，通过调整图像的明暗度、饱和度等参数使得兽用B超图像更易分辨，必要时也可以对兽用B超图像进行放大、缩小处理，以便测量；超声诊断的关键是获得精确的测量数据，这样才能作出正确的诊断，因此，系统设计实现了基准校正功能，即按照一个已知物理长度的标尺在兽用B超图像上测量相应的像素数，然后折算出一个标准(mm/像素)，从而得到测量部位的精确数据；在测量窗口中通过按键依次选择打开一个病历的所有兽用B超图像文件，进行处理测量，最终将测量数据保存到系统中。

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